La máxima autoridad de FUNDEPI reside en la Asamblea de miembros. La dirección y administración está a cargo de una Junta Directiva formada por: Dra. Marisela Perdomo (Presidenta), Dra. Noelva López (Vice-presidenta), Dra. Ivonne Romero (Tesorera) y Dra. Ana María Zulueta (Secretaria).

Su ámbito de trabajo es la Salud Pública en general y la Epidemiología en particular.

Domiciliada en la ciudad de Caracas (Venezuela) puede establecer sucursales, agencias, oficinas o representaciones en cualquier otro país.

Su patrimonio proviene de la aportación de sus miembros, de donaciones o subsidios de personas naturales o entes públicos o privados y de los ingresos provenientes de las actividades por ella realizadas.

En colaboración con las Gobernaciones, Alcaldías, Ministerio de Salud y Desarrollo Social, Institutos Autónomos y entes descentralizados (I.N.N, Insalud, Corposalud) ha realizado actividades de investigación, capacitación y fortalecimiento de los servicios de epidemiología.