O embrião do Projeto Cananéia data de meados de 1992, através de contatos com acadêmicos de várias unidades da USP ligadas à saúde. Inicialmente seria realizado em Iguape com a participação da Faculdade de Medicina. Ao final de 1992, o projeto desmembrou-se devido a desistência das outras unidades. A Faculdade de Odontologia (FOUSP) alterou o local a ser assistido para a Estância de Cananéia, aproveitando a base do Instituto Oceanográfico (IO - USP)- vide foto acima.
Em 31 de janeiro de 1993, deu-se o primeiro trabalho de campo para o reconhecimento do município e das condições de alojamento do IO e para o estabelecimento de contatos com a prefeitura, com a Secretaria de Saúde, com o Centro de Saúde e Odontológico e com a direção das Escolas.
Em abril de 1993, 12 alunos da FOUSP colheram em Cananéia uma amostragem de 854 exames clínicos visuais em crianças escolares do primário das três Escolas Públicas da área urbana. Em outubro do mesmo ano, contando com a participação de 16 alunos, iniciaram as atividades clínicas apenas atuando nas crianças autorizadas pelos responsáveis.
Desde então, as atividades do Projeto tem periodicidade semestral e conta com a participação voluntária dos alunos de graduação da FOUSP.
Os dados armazenados desde o levantamento inicial visam o controle da efetividade da metodologia implantada. Além da melhoria das condições de saúde bucal das crianças, o programa visa formar na comunidade local, líderes que possam difundir a educação para a saúde e colocar o aluno de odontologia em contato com a realidade da saúde bucal no Brasil, despertando nele a idéia que é ele o gerador de mudanças dessa precária realidade.
